El Consejo Cantonal de la Juventud (CCJ) de Santa Cruz nace oficialmente el 24 de Agosto del 2006, como una iniciativa desarrollada a través del Proyecto Consejos Locales juveniles desarrollado por la Fundación Futuro Latinoamericano (FFLA); con la finalidad de generar un espacio para el desarrollo de mejores practicas de gobernabilidad, participativa y transparente, que fomente la participación activa de los jóvenes dentro de los procesos de Gobernabilidad y desarrollo de su Cantón.

Con el fin de poner esta propuesta a consideración de los jóvenes de Santa Cruz, la FFLA hace un proceso de convocatoria pública a través de los medios de comunicación, y de charlas en colegios, universidades y espacios públicos. Esta primera convocatoria fue seguida por visitas a los lideres de los principales sectores gremiales, institucionales y de la sociedad civil para pedir su apoyo en la identificación de jóvenes lideres. De este proceso se eligieron a 40 jóvenes que fueron invitados a un primer taller para definir participativamente como debería elegirse el CCJ y cuales deberían ser sus atribuciones, funciones y organización interna.

Las bases juveniles asumen el CCJ desde una aspiración para desarrollar mecanismos que permitan fortalecer la participación de jóvenes en los procesos locales como a su vez desarrollar iniciativas que permitan y mejoren la calidad de vida de la comunidad de Santa Cruz en especial sus Jóvenes; eligen a los 10 miembros del CCJ, quienes los representarán y trabajaran en coordinación con las bases.

Mediante la  "Ordenanza que conforma y regula el Consejo Cantoan de la Juventud" (95.84 kB) expedida el 21 de Diciembre del 2006, el Gobierno Municipal de Santa Cruz da vida legal a este organismo para que pueda desarrollar propuestas y proyectos en pro de la juventud local, adicionalmente otorga la potestad a este cuerpo colectivo para desarrollar el primer “Plan Cantonal de la Juventud de Santa Cruz”.